La mise en place du paiement sécurisé sur un site marchand permet de boucler tout le cycle d'achat sur Internet sans passer par d'autres moyens de communication que le réseau lui-même. Il existe aujourd'hui beaucoup de solutions homologuées qu'il suffit de déployer à partir d'une application d'e-commerce pour garantir à l'internaute la confidentialité de ses transactions. Cependant la mise en place et la maintenance de cette infrastructure a un coût sous forme de frais d'installation ou d'abonnement dont il faut s'acquitter soit auprès des organismes bancaires soit auprès du propriétaire de la solution de paiement sécurisée elle-même.